自然資源部第三海洋研究所(簡(jiǎn)稱(chēng)海洋三所)成立于1959年，是中華人民共和國(guó)自然資源部直屬的國(guó)家公益一類(lèi)綜合型海洋科學(xué)研究機(jī)構(gòu)，位于福建省廈門(mén)市。

研究所主要從事海洋基礎(chǔ)研究、應(yīng)用研究和高新技術(shù)研究，重點(diǎn)發(fā)展深海生物研究與海洋生物資源開(kāi)發(fā)利用、全球變化與區(qū)域海洋響應(yīng)、海洋生物多樣性與生態(tài)系統(tǒng)保護(hù)、應(yīng)用海洋學(xué)四個(gè)學(xué)科領(lǐng)域等研究方向;同時(shí)，研究所是國(guó)家海洋標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)生物資源開(kāi)發(fā)與保護(hù)分技術(shù)委員會(huì)、中國(guó)海洋學(xué)會(huì)海洋生物資源專(zhuān)業(yè)委員會(huì)、中國(guó)海洋工程咨詢(xún)協(xié)會(huì)環(huán)境生態(tài)專(zhuān)業(yè)委員會(huì)、中國(guó)太平洋學(xué)會(huì)危險(xiǎn)品與放射性評(píng)估分會(huì)、中國(guó)生態(tài)學(xué)會(huì)海洋生態(tài)專(zhuān)業(yè)委員會(huì)以及福建省海洋學(xué)會(huì)的依托單位。

根據(jù)2019年3月研究所官網(wǎng)顯示，自然資源部第三海洋研究所有編制505人;擁有10個(gè)研究部門(mén)及廈門(mén)海洋工程勘察設(shè)計(jì)研究院;有在讀碩、博士研究生160多人。